１２球団のドラフト１位指名選手が出そろった。今夏の甲子園の優勝投手、東海大相模の小笠原慎之介は、２回目の入札でも中日と日本ハムが競合し、抽選の結果、中日が交渉権を獲得した。
ソフトバンク ◎高橋純平投手（県岐阜商高）
日本ハム ▲上原健太投手（明大）←小笠原慎之介投手（東海大相模高）←高橋純平投手（県岐阜商高）
西武 多和田真三郎投手（富士大）
ロッテ ◎平沢大河内野手（仙台育英高）
オリックス 吉田正尚外野手（青学大）
楽天 ▲オコエ瑠偉外野手（関東第一高）←平沢大河内野手（仙台育英高）
ヤクルト ▲原樹理投手（東洋大）←高山俊投手（明大）
巨人 桜井俊貴投手（立命館大）
阪神 ◎高山俊投手（明大）
広島 岡田明丈投手（大商大）
中日 ▲小笠原慎之介投手（東海大相模高）←高橋純平投手（県岐阜商高）
ＤｅＮＡ 今永昇太投手（駒大）
◎は抽選で交渉権獲得 ▲はいわゆる「外れ１位」
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